8.3/10 (74 أصوات )

Flapjack هو النمط الجيني الرسومية. تحرير بواسطة بكالوريوس المحرر : أدوات جديدة لبرامج الرسم والتنميط الجيني التصور haplotype مطلوبة بشكل روتيني يمكن أن تتعامل مع كميات كبيرة من البيانات الناتجة عن ارتفاع إنتاجية الحزب الوطني الاسكتلندي وقابلة للمقارنة التكنولوجيات التنميط الجيني. Flapjack هو التصور الجديد أداة لتسهيل تحليل هذه الأنواع من البيانات. وتصورات يتم تقديمها في الوقت الحقيقي مما يسمح للملاحة السريع ومقارنات بين الخطوط والعلامات وchromosomes.Based على المدخلات من الخريطة ، وراثى البيانات سمة Flapjack قادرة على توفير عدد من وجهات نظر بديلة راثى الرسومية مع الأليلات الفردية الملونة من قبل الدولة والتردد أو التشابه إلى خط معين القياسية. Flapjack تدعم مجموعة من التفاعلات مع البيانات ، بما في ذلك بالرسوم والصور المتحركة أو علامات حول خطوط العرض ، الإدراج أو الحذف من البيانات ، والفرز أو تجميع خطوط إما عن طريق التشابه الوراثي للخطوط الأخرى ، أو من جانب عشرات السمات. وأي خريطة تستند المعلومات مثل QTL تكون المواقف المنحازة ضد الأنماط البيانية لتحديد النتائج المرتبطة haplotypes.All يتم حفظها في إكس إم شكل يستند المشروع ، ويمكن أيضا أن تكون البيانات الخام وتصديره أو بالرسوم والصور وملفات الصور. لقد ابتكرنا كفاءة هياكل تخزين البيانات التي توفر سرعة عالية الوصول إلى أي مجموعة فرعية من البيانات ، مما أدى إلى تصور سريع بغض النظر عن حجم البيانات. Flapjack يمكن بسهولة التعامل مع مجموعات البيانات التي تقترب من 1 بليون (109) المورثات في حجم 32 بت على معظم أنظمة التشغيل.



  • مرات التنزيل: 311
  • متطلبات التشغيل: Windows XP
  • الحجم: 19.17MB
  • الترخيص: Freeware Free
  • الاصدار :
  • اضيف في: 0000-00-00 00:00:00
  • اخر تحديث: 21/10/2009
  • الموقع علي الانترنت:






Description

"Flapjack is a Graphical Genotyping."Edit By BS Editor: New software tools for graphical genotyping and haplotype visualization are required that can routinely handle the large data volumes generated by high throughput SNP and comparable genotyping technologies. Flapjack is a new visualization tool to facilitate analysis of these data types. Its visualizations are rendered in real-time allowing for rapid navigation and comparisons Between lines, markers and chromosomes.Based on the input of map, genotype and trait data Flapjack is able to provide a number of alternative graphical genotype views with individual alleles coloured by state, Frequency or Similarity to a given standard line. Flapjack supports a range of interactions with the data, including graphically moving lines or markers around the display, insertions or deletions of data, and sorting or clustering of lines by either genotype similarity to other lines, or by trait scores. Any map based information such as QTL positions can be aligned against graphical genotypes to identify associated haplotypes.All results are saved in an XML-based project format and can also be exported as raw data or graphically as image files. We have devised efficient data storage structures that provide high-speed access to any subset of the data, resulting in fast visualization regardless of the size of the data. Flapjack can comfortably handle data sets approaching 1 billion (109) genotypes in size on most 32 bit operating systems.
صور Flapjack
Flapjack





التعليقات علي Flapjack
اضافة تعليق

تعليقات الفيسبوك

تعليقات الموقع